Ціанобактерії України: систематична структура флори (2024)
Автор(и)
Розділ:
Систематика, філогенія, питання еволюції водоростейНомер:
Том 34 № 2 (2024)Сторінки:
91-103DOI:
https://doi.org/10.15407/alg34.02.91Анотація
Систематика ціанобактерій переживає період швидких змін, пов’язаних із появою нових молекулярних маркерів, удосконаленням молекулярно-філогенетичних методів та широким застосуванням комплексного підходу при описі нових таксонів. Було показано, що багато ознак, які вважалися таксономічно значущими, незалежно виникали у різних філогенетичних лініях у ході еволюції ціанобактерій, а генетичне різноманіття таксонів часто значно перевищує морфологічне. Спроби поєднати підходи морфологічної систематики з молекулярними даними не вирішували проблеми, хоча й допомагали систематизувати результати флористичних досліджень. Поява нової класифікаційної системи ціанобактерій (НКСЦ), при створенні якої автори спирались на геномну філогенію та філогенію на основі гена 16S рРНК, визначила необхідність перегляду систематичної структури флори ціанобактерій України, оскільки її останній опублікований варіант, що базувався на таксономічних відомостях станом на 2021 р., вже не відповідає сучасній класифікації ціанобактерій. У роботі проаналізовано основні нововведення НКСЦ та зміни, що відбулися з провідними таксонами української флори, а також наведено оновлену систематичну структуру ціанобактерій України.
Ключові слова:
ціанобактерії, систематика, нова класифікація, таксономічна структура, УкраїнаТекст статті
Посилання
Anagnostidis K., Komárek J. 1988. Modern approach to the classification system of сyanophytes. 3. Oscillatoriales. Algol. Stud./Arch. Hydrobiol. Suppl. 80(50–53): 327–472.
Boyer S.L., Johansen J.R., Flechtner V.R. 2002. Phylogeny and genetic variance in terrestrial Microcoleus (Cyanophyceae) species based on sequence analysis of the16S rRNA gene and associated 16S-23S ITS region. J. Phycol. 38: 1222–1235. https://doi.org/10.1046/j.1529-8817.2002.01168.x
Casamatta D.A., Vis M.L., Sheath R.G. 2003. Cryptic species in cyanobacterial systematics: a case study of Phormidium retzii (Oscillatoriales) using RAPD molecular markers and 16S rDNA sequence data. Aquat. Bot. 77(4): 295–309. https://doi.org/10.1016/j.aquabot.2003.08.005
Dvořák P., Jahodářová E., Casamatta D.A., Hašler P., Poulíčková A. 2018. Difference without distinction? Gaps in cyanobacterial systematics; when more is just too much. Fottea (Olomouc). 18(1): 130–136. https://doi.org/10.5507/fot.2017.023
Dvořák P., Poulíčková A., Hašler P., Belli M., Casamatta D.A., Papini A. 2015. Species concepts and speciation factors in cyanobacteria, with connection to the problems of diversity and classification. Biodivers. Conserv. 24: 739–757. https://doi.org/10.1007/s10531-015-0888-6
Hoffmann L., Komárek J., Kastovsky J. 2005. System of Cyanoprokaryotes (Cyanobacteria) - State in 2004. Algol. Stud. 117(1): 95–115. https://doi.org/10.1127/1864-1318/2005/0117-0095
Johansen J.R., Casamatta D.A. 2005. Recognizing cyanobacterial diversity through adoption of a new species paradigm. Arch. Hydrobiol./Algol. Stud. 117(1): 71–93. https://doi.org/10.1127/1864-1318/2005/0117-0071
Komárek J., Anagnostidis K. 1986. Modern approach to the classification system of cyanophytes, 2. Chroococcales. Arch. Hydrobiol./Algol. Stud.43: 157–226.
Komárek J., Anagnostidis K. 1989. Modern approach to the classification system of cyanophytes. 4. Nostocales. Arch. Hydrobiol./Algol. Stud. 56:247-435.
Komárek J., Anagnostidis K. 1998. Cyanoprokaryota. 1. Teil: Chroococcales. In: Süsswasserflora von Mitteleuropa. Bd 19/1. Jena; etc.: Gustav Fisher. 548 p.
Komárek J. 2013. Cyanoprokaryota. 3. Heterocytous genera. In: Süswasserflora von Mitteleuropa. Berlin, Heidelberg: Springer Spektrum. 1130 p.
Komárek J. 2016. A polyphasic approach for the taxonomy of cyanobacteria: principles and applications. Eur. J. Phycol. 51(3): 346–353. https://doi.org/10.1080/09670262.2016.1163738
Komárek J., Kaštovský J., Mareš J., Johansen J.R. 2014. Taxonomic classification of cyanoprokaryotes (cyanobacterial genera) 2014 using a polyphasic approach. Preslia. 6(4): 295–335.
Mareš J., Strunecký O., Bučinská L., Wiedermannová J. 2019. Evolutionary patterns of thylakoid architecture in cyanobacteria. Front. Microbiol. 10: 277. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00277 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30853950 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6395441
Mikhailyuk T.I., Vinogradova O.M., Gromakova A.B., Glaser K., Karsten U. 2023. A polyphasic approach leading to the discovery of new taxa of terrestrial Cyanobacteria for the flora of Ukraine. Int. J. Algae. 25(4): 301–322. https://doi.org/10.1615/InterJAlgae.v25.i4.10
Siegesmund M.A., Johansen J.R., Karsten U., Friedl T. 2008. Coleofasciculus gen. nov. (Cyanobacteria): morphological and molecular criteria for revision of the genus Microcoleus Gomont. J. Phycol. 44: 1572–1585. https://doi.org/10.1111/j.1529-8817.2008.00604.x https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27039870
Strunecký O., Ivanova A.P., Mareš J. 2023. An updated classification of cyanobacterial orders and families based on phylogenomic and polyphasic analysis. J. Phycol. 59(1): 12–51. https://doi.org/10.1111/jpy.13304 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/36443823
Thuret G. 1875. Essay de classification des Nostochinées. Ann. Sci. Nat. Bot. Sér. 6(1): 372–382.
Vinogradova O.M. 2022. Cyanobacteria of Ukraine: actual diversity, trends of taxonomic changes, features of zonal and ectopic distribution. Algologia. 32(4): 309–339. [Виноградова О.М. 2022. Ціанобактерії України: актуальне різноманіття, тенденції таксономічних змін, особливості зонального та ектопічного поширення. Альгологія. 32(4): 309–339]. https://doi.org/10.15407/alg32.04.309
Whitton B.A., Potts M. 2012. Introduction to the cyanobacteria. In: Ecology of Cyanobacteria. II: Their Diversity in Space and Time. Dordrecht: Springer Science+Business Media B.V: pp. 1–13. https://doi.org/10.1007/978-94-007-3855-3_1
